后續(xù)來了…
師兄師兄,反轉(zhuǎn)錄真的好簡單啊,操作說明都只有豆腐大一塊,提RNA的有兩三頁呢!
是不是覺得組分一加、模板一加,上機(jī),so easy?
是啊是啊,就這我還能出錯(cuò)?
哦,這么自信?那我考考你,反轉(zhuǎn)錄體系組成都有哪些?
這個(gè)我知道!酶、buffer、引物、模板RNA、無酶水!
可以的嘛,現(xiàn)在大多試劑盒都提供預(yù)混Mix了,我們只需要加引物、模板、水就可以了。那么,模板用量是多少你知道不?
…隨便加點(diǎn)?
這?!…要不要去基因組RNA?
要,…還是不要?
算了吧你…來,師兄給你好好說說。
一般來說,反轉(zhuǎn)錄模板RNA添加量要嚴(yán)格按照產(chǎn)品說明書建議用量添加,過多會抑制反轉(zhuǎn)錄效率,過少會使下游PCR、qPCR實(shí)驗(yàn)cDNA模板量過低。而且,要注意根據(jù)提取純化的RNA濃度調(diào)整添加體積哦。
如果你下游實(shí)驗(yàn)為qPCR,可以使用福際生物的RT Easy II,這個(gè)是qPCR專用第一鏈cDNA合成試劑盒,預(yù)混了優(yōu)化配比的Oligo(dT)引物與隨機(jī)引物,可以省略添加引物的步驟。
但你的研究樣本是miRNA,就要根據(jù)說明書建議量添加你自己合成的特異性引物。
哦,我明白了。那我做的是RNA,怎么又扯上基因組DNA了呢?
傳統(tǒng)方法提取RNA的過程中極易混入少量基因組DNA,因此在后續(xù)檢測過程中有可能出現(xiàn)假陽性現(xiàn)象,會影響對后續(xù)實(shí)驗(yàn)結(jié)果的判斷。這時(shí)你就要考慮去除殘留的基因組DNA。
可以設(shè)置無反轉(zhuǎn)錄對照(no-RT control)——即含有除反轉(zhuǎn)錄酶以外的所有成分——來確定是否存在基因組DNA干擾。
要避免殘留基因組DNA對實(shí)驗(yàn)結(jié)果的影響,可以在提取時(shí)使用DNA去除效果好的福際總RNA提取試劑盒;或者使用去基因組的反轉(zhuǎn)錄產(chǎn)品,比如福際的RT Easy II (with gDNase)。還有一種方法是設(shè)計(jì)跨內(nèi)含子引物,也可以達(dá)到避免基因組DNA干擾的目的。
哦,原來反轉(zhuǎn)錄還有這么多坑,謝謝師兄,我去做實(shí)驗(yàn)了~