產(chǎn)品名稱 | 多糖多酚植物種子(小型)直接PCR試劑盒-防PCR產(chǎn)物污染體系 Plant Seed Direct PCR Kit I -UNG | ||
貨 號(hào) | TP-03161 | TP-03163 | |
規(guī) 格 | 200 T | 2000 T | |
價(jià) 格 | ¥1,760.00 | ¥15,050.00 | |
描 述 | 直接使用多糖多酚種子裂解液作為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增,無(wú)需單獨(dú)抽提DNA,快速,靈敏度高,適合快速大規(guī)?;驒z測(cè)。 增加了UNG防污染體系,杜絕假陽(yáng)性;試劑盒包含裂解液/PCR Mix |
產(chǎn)品名稱 | 多糖多酚植物種子(大中型)直接PCR試劑盒-防PCR產(chǎn)物污染體系 Plant Seed Direct PCR Kit II -UNG | ||
貨 號(hào) | TP-03181 | TP-03183 | |
規(guī) 格 | 200 T | 2000 T | |
價(jià) 格 | ¥2,086.00 | ¥17,234.00 | |
描 述 | 直接使用多糖多酚種子裂解液作為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增,無(wú)需單獨(dú)抽提DNA,快速,靈敏度高,適合快速大規(guī)?;驒z測(cè)。 增加了UNG防污染體系,杜絕假陽(yáng)性;試劑盒包含裂解液/PCR Mix |
產(chǎn)品介紹
本產(chǎn)品采用獨(dú)特的裂解反應(yīng)體系,能夠快速的從多糖多酚含量高的植物種子樣本(如:香蕉、棉花等)中釋放出基因組DNA,用于PCR反應(yīng),因此特別適合大規(guī)模基因檢測(cè)。為了滿足不同檢測(cè)試驗(yàn)的需要,本試劑盒可以使用多種類型的樣本(如完整種子、微量組織切塊或多顆種子的磨碎樣本)進(jìn)行實(shí)驗(yàn)。其中,對(duì)于還需要進(jìn)行萌發(fā)的種子樣本,可以選擇切取種胚以外的微量組織切塊(1-5mg)進(jìn)行實(shí)驗(yàn);對(duì)于需要在大量樣本中進(jìn)行抽樣檢測(cè)的實(shí)驗(yàn),可以選擇將多個(gè)樣本混合并磨碎成直徑0.5mm左右的顆粒后再進(jìn)行實(shí)驗(yàn)(最低可以檢測(cè)出0.1%的目的樣本)。
裂解反應(yīng)體系釋放基因組DNA過(guò)程可以在5-10min內(nèi)完成,不需要其他去蛋白、RNA或者次生代謝產(chǎn)物的過(guò)程,即可將釋放出的微量DNA作為模板進(jìn)行PCR反應(yīng)。
2× Seed PCR EasyTM Mix具有很強(qiáng)的PCR反應(yīng)抑制物耐受性,能直接以植物材料的裂解混合液為模板,進(jìn)行高效特異性擴(kuò)增。該試劑包含公司專門針對(duì)直接PCR改造的D-Taq DNA Polymerase、dNTPs、MgCl2、反應(yīng)緩沖液、PCR反應(yīng)增強(qiáng)劑、優(yōu)化劑和穩(wěn)定劑。與裂解反應(yīng)體系配合使用能夠快速簡(jiǎn)便地對(duì)樣品進(jìn)行檢測(cè),并具有靈敏度高、特異性強(qiáng)、穩(wěn)定性好等特點(diǎn)。
2× Seed PCR EasyTM Mix(UNG)在2× Seed PCR EasyTM Mix的基礎(chǔ)上用dUTP替代了dTTP,并同時(shí)加入能夠降解含有dUTP模板的UNG酶(Uracil-N-glycosylase)。在PCR反應(yīng)前,利用UNG酶降解含有尿嘧啶的PCR產(chǎn)物,UNG酶對(duì)不含有尿嘧啶的模板不會(huì)造成任何影響,從而保證擴(kuò)增的特異性和準(zhǔn)確性,防止了大規(guī)?;驒z測(cè)時(shí)可能出現(xiàn)的PCR產(chǎn)物污染問(wèn)題。
D-Taq DNA polymerase是Foregene為直接PCR反應(yīng)專門研制出的DNA polymerase。D-Taq DNA polymerase對(duì)多種PCR反應(yīng)抑制劑具有極強(qiáng)的的耐受性、在各種復(fù)雜反應(yīng)體系中均能高效擴(kuò)增痕量的DNA,擴(kuò)增速度可達(dá)2Kb/min,特別適合進(jìn)行直接PCR反應(yīng)。
根據(jù)植物樣本差異,該產(chǎn)品分為兩個(gè)大類:植物種子直接PCR試劑盒(Plant Seed Direct PCR Kit)和多糖多酚植物種子直接PCR試劑盒(Plant Seed Direct PCR Plus Kit)。在裂解階段,考慮到不同類型的種子或組織材料在裂解過(guò)程中試劑用量差異較大,客戶可根據(jù)自己實(shí)驗(yàn)材料的大小選擇相應(yīng)的植物種子(中小型)直接PCR試劑盒或植物種子(大型)直接PCR試劑盒;在PCR檢測(cè)階段,客戶也可以根據(jù)實(shí)驗(yàn)需求,選用普通的2× Seed PCR EasyTM Mix或是具有防PCR擴(kuò)增產(chǎn)物污染作用的2× SeedPCR EasyTM Mix(UNG)。
試劑盒應(yīng)用
適用范圍:多種多糖多酚植物種子。
樣本裂解釋放的DNA:僅用作PCR模板。
試劑盒可用于以下用途:轉(zhuǎn)基因種子鑒定、植物基因分型等。
試劑盒局限性
擴(kuò)增片段≤1kb;超過(guò)1kb,擴(kuò)增效率下降或者擴(kuò)增失敗。
UNG防PCR產(chǎn)物污染體系得到的PCR產(chǎn)物請(qǐng)勿用于基因克隆或測(cè)序。
PCR產(chǎn)物3’末端隨機(jī)加A尾。
試劑盒內(nèi)容
Buffer SSP1:提供多糖多酚植物種子裂解反應(yīng)所需的環(huán)境。
Buffer SSP2:補(bǔ)充提供多糖多酚植物種子裂解反應(yīng)所需的環(huán)境。
Buffer SP2:中和裂解產(chǎn)物,使其不影響后續(xù)PCR反應(yīng)。
2× Seed PCR EasyTM Mix(UNG):在2× Leaf PCR EasyTM Mix的基礎(chǔ)上用dUTP替代了dTTP,并同時(shí)加入能夠降解含有dUTP模板的UNG酶,從而能夠有效防止PCR擴(kuò)增產(chǎn)物污染。包含福際生物特別改造的D-Taq DNA Polymerase、UDG、dNTPs、MgCl2、反應(yīng)緩沖液、PCR反應(yīng)增強(qiáng)劑、優(yōu)化劑以及穩(wěn)定劑等。PCR反應(yīng)時(shí),只需將適當(dāng)?shù)牧呀饣旌弦?、引物?/span>ddH2O添加到2×Seed PCR EasyTM Mix(UNG)中即可用于PCR反應(yīng)。
6× DNA Loading Buffer:該Loading Buffer中不含有SDS。建議在進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳時(shí),配搭使用試劑盒附贈(zèng)的6× DNA Loading Buffer,以便取得好的電泳結(jié)果。切勿使用含有SDS的Loading Buffer,否則在電泳時(shí)會(huì)在泳道中有一大團(tuán)拖尾亮光,影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果。
儲(chǔ)存條件
全程低溫冰盒運(yùn)輸,保證試劑盒Part I、Part II處于<4℃狀態(tài)。
本試劑盒Part I保存在2-8℃。
v 試劑Buffer SP1、Buffer SP2、6× DNA Loading Buffer在干燥條件下,可保存12個(gè)月;如需保存更長(zhǎng)時(shí)間可置于2–8℃。
本試劑盒Part II保存在-20℃。
v 試劑2× Seed PCR EasyTM Mix(UNG),在-20℃條件下可保存12個(gè)月;若頻繁使用,也可置于4℃短期保存(限10天內(nèi)用完)。
操作流程
說(shuō)明書
產(chǎn)品文獻(xiàn)
MSDS
COA
正對(duì)照、待測(cè)樣本均無(wú)條帶
Answer
在試劑盒的使用過(guò)程中往往會(huì)遇到許多問(wèn)題,比如:沒(méi)有PCR擴(kuò)增產(chǎn)物、PCR特異性差等,以下就分別對(duì)使用植物種子直接PCR系列試劑盒可能會(huì)遇到的問(wèn)題進(jìn)行分析。建議在進(jìn)行直接PCR的同時(shí)設(shè)置陽(yáng)性對(duì)照或陰性對(duì)照以便后續(xù)分析實(shí)驗(yàn)結(jié)果。
1. PCR反應(yīng)體系或反應(yīng)條件不合適。
建議:使用梯度PCR摸索PCR最佳反應(yīng)條件。
2. PCR試劑保存不當(dāng)失去活性。
建議:2× Seed PCR EasyTM Mix(UNG)應(yīng)保存于-20℃,使用時(shí)避免反復(fù)凍融。若使用頻繁,可在4℃短時(shí)間存放。
3. 引物設(shè)計(jì)問(wèn)題。
建議:嘗試重新設(shè)計(jì)引物進(jìn)行檢查。
正對(duì)照有目的條帶,待測(cè)樣本無(wú)條帶或條帶弱
Answer
1. 種子中多糖多酚含量較高,裂解混合液呈棕黃色甚至棕紅色。
建議:使用多糖多酚植物種子直接PCR試劑盒(Plant Seed Direct PCR Plus Kit)。
2. 裂解液、中和液加入比例不當(dāng),裂解混合液影響PCR體系的pH值。
建議:正常條件下,中和后的裂解混合液的pH應(yīng)該在7-8左右(普通植物種子直接PCR試劑盒,裂解產(chǎn)物和Buffer SP2嚴(yán)格按照1:1的量進(jìn)行中和;多糖多酚植物種子直接PCR試劑盒,裂解產(chǎn)物和Buffer SP2嚴(yán)格按照8:5的量進(jìn)行中和)。
3. 樣本裂解混合液保存不當(dāng)或保存時(shí)間過(guò)久,DNA基因組已經(jīng)降解。
建議:裂解混合液可在4℃保存5天,盡量使用新制備的裂解液混合液進(jìn)行PCR。
4. 裂解混合液中抑制物過(guò)多。
建議:在PCR反應(yīng)體系5-20%范圍內(nèi)優(yōu)化模板加入量。
5. PCR循環(huán)數(shù)不足。
建議:適當(dāng)增加PCR的循環(huán)數(shù),推薦在35-40循環(huán)為佳。因?yàn)槟0鍙?fù)雜,一般PCR反應(yīng)要比用純化的DNA模板多5-10個(gè)循環(huán)為佳。
非特異性擴(kuò)增
Answer
1. 退火溫度偏低。
建議:適當(dāng)提高退火溫度。
2. PCR循環(huán)數(shù)過(guò)多。
建議:適當(dāng)降低循環(huán)次數(shù),推薦在35-40循環(huán)為佳。
3. 引物濃度偏高。
建議:適量降低引物用量。通常引物終濃度為0.2μM可以得到較好結(jié)果。反應(yīng)性能較差時(shí),可以在0.1-0.5μM范圍內(nèi)調(diào)整引物濃度。
4. PCR模板加入量過(guò)多。
建議:配制PCR反應(yīng)體系時(shí),適量減少模板加入量。
空白對(duì)照出現(xiàn)目的條帶
Answer
1. 操作工具或試劑污染。
建議:實(shí)驗(yàn)所有試劑或器材均應(yīng)高壓滅菌。實(shí)驗(yàn)時(shí)應(yīng)規(guī)范操作,避免在加樣操作中溶液倒吸或飛濺。
2. 樣本間交叉污染。
建議:每個(gè)取樣器只對(duì)一個(gè)樣本使用;或取完一個(gè)樣本后,將取樣器刃口或與樣本直接接觸的部位浸入2%的次氯酸鈉溶液中,反復(fù)涮洗數(shù)次進(jìn)行清洗,然后用干凈的紙巾擦干殘液后再進(jìn)行使用。
3. PCR產(chǎn)物污染。
建議:如果實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)同類型樣本多,最好使用UNG防PCR產(chǎn)物污染系統(tǒng)的試劑盒進(jìn)行實(shí)驗(yàn)。
快速的從多糖多酚植物的葉片樣本中釋放出基因組DNA,用于PCR反應(yīng),并采用UNG防PCR產(chǎn)物污染體系,因此特別適合大規(guī)?;驒z測(cè)。
快速的從多糖多酚植物的葉片樣本中釋放出基因組DNA,用于PCR反應(yīng),因此特別適合大規(guī)?;驒z測(cè)。
快速的從植物(如:水稻、小麥、煙草、玉米、大豆、油菜等)的葉片樣本中釋放出基因組 DNA,用于 PCR 反應(yīng),因此特別適合大規(guī)?;驒z測(cè)。