無(wú)RNA酶污染：試劑盒提供的DNA-Only Column使得實(shí)驗(yàn)過(guò)程中無(wú)需額外添加RNA酶即可去除基因組DNA中的RNA，避免實(shí)驗(yàn)室遭受外源RNA酶污染。
速度快：操作簡(jiǎn)單，土壤基因組DNA提取操作在90分鐘內(nèi)即可完成。
方 便：離心操作均在常溫，無(wú)需4℃低溫離心或乙醇沉淀DNA。
安 全：無(wú)需有機(jī)試劑抽提。
質(zhì)量高：提取獲得的基因組DNA片段大、無(wú)RNA、無(wú)RNA酶、離子含量極低，能滿足各種實(shí)驗(yàn)的要求。
產(chǎn) 品 名 稱(chēng) | 土壤基因組DNA提取試劑盒 Soil DNA Isolation Kit |
貨 號(hào) | DE-05513 |
規(guī) 格 | 50T |
價(jià) 格 | ￥762.00 |
描 述 | 快速?gòu)母鞣N土壤樣本微生物中純化獲得高質(zhì)量的基因組DNA。 |
產(chǎn)品介紹
本試劑盒提供了從各種來(lái)源的土壤中快速簡(jiǎn)便的提取基因組DNA的方法。土壤樣品中存在大量的抑制因子如腐殖酸、金屬離子等，這些物質(zhì)即使微量存在于純化后的DNA中也會(huì)對(duì)下游反應(yīng)，如對(duì)PCR、限制性酶切等產(chǎn)生影響。因而純化土壤DNA的關(guān)鍵在于如何有效的去除土壤中的抑制因子。
本試劑盒采用可以特異性結(jié)合DNA的DNA-Only Column、全新的Foregene Protease以及獨(dú)特的緩沖液體系，可以有效的去除土壤中各種抑制因子，無(wú)需有機(jī)溶劑抽提或乙醇及異丙醇沉淀，在90分鐘內(nèi)即可完成對(duì)土壤樣品中DNA的提取操作。
試劑盒應(yīng)用
該試劑盒適用于純化以下樣本基因組DNA：淤泥樣本、花壇土、踩地土、樹(shù)林土、荒地土、池塘土、湖邊土、草坪土等樣本。
純化DNA的應(yīng)用
土壤基因組DNA提取試劑盒純化獲得的基因組DNA純度高，可用于常規(guī)分子生物學(xué)操作，如：酶切、PCR、Southern雜交、文庫(kù)構(gòu)建等實(shí)驗(yàn)。
DNA提取得率和純度
提取獲得的土壤基因組DNA量與土壤樣本的來(lái)源、存放時(shí)間、水分含量等因素相關(guān)。根據(jù)Soil DNA Isolation Kit處理各種來(lái)源土壤樣本，獲得的基因組DNA量和純度見(jiàn)下表：
土壤來(lái)源 | 樣本用量(mg) | DNA產(chǎn)量(μg) | OD260/280 | OD260/230 |
花壇土 | 500 | 4-5 | 1.7-1.9 | 1.7-1.9 |
草地土(多石子) | 500 | 4-6 | 1.7-1.9 | 1.8-1.9 |
樹(shù)林土 | 500 | 4-6 | 1.7-1.9 | 1.7-1.8 |
草坪土 | 500 | 6-10 | 1.7-1.8 | 1.8-2.0 |
湖邊 | 500 | 6-10 | ≈1.8 | 1.9-2.0 |
松樹(shù)林下 | 500 | 8-12 | ≈1.8 | 1.8-1.9 |
池塘淤泥 | 500 | 6-8 | 1.7-1.8 | 1.7-1.8 |
注意：此表數(shù)據(jù)僅作參考，實(shí)際操作中由于所用材料的存儲(chǔ)條件、操作熟練度等因素影響，所得數(shù)據(jù)會(huì)與此表數(shù)據(jù)有些許出入。
試劑盒內(nèi)容
Lysozyme：酶解陽(yáng)性菌細(xì)胞壁。
Buffer TE：用于配制100mg/mL Lysozyme的溶液和提供溶菌酶酶解環(huán)境。
Buffer SG1 & Buffer SG2：提供樣本蛋白酶酶解環(huán)境。
Foregene Protease：在蛋白酶酶解環(huán)境下酶解樣本，釋放基因組DNA。
Buffer SG3：失活Foregene Protease，并提供DNA上柱環(huán)境。
Buffer SG4：補(bǔ)充提供DNA上柱環(huán)境。
Buffer PW：去除DNA中的蛋白質(zhì)、RNA等雜質(zhì)。
Buffer WB：去除DNA中的殘留的鹽離子。
Buffer EB：洗脫純化柱膜上的DNA。
DNA-only Column：特異吸附裂解產(chǎn)物中的基因組DNA。
產(chǎn)品信息
型號(hào) | 離心柱型 | 純化組件 | Foregene離心柱、試劑 |
通量 | 1-24個(gè)樣品 | 制備時(shí)間 | 90 min (24個(gè)樣品) |
離心機(jī) | 臺(tái)式離心機(jī) | 樣本酶解物分離 | 離心分離 |
離心柱液體盛裝量 | 800 μL | 純化柱DNA承載量 | 80 μg |
洗脫體積 | 100-200 μL | 土壤樣本處理量 | < 500 mg |
操作流程
說(shuō)明書(shū)
產(chǎn)品文獻(xiàn)
Organic Houttuynia cordata Thunb harbors higher abundance and diversity of antibiotic resistance genes than non-organic origin, suggesting a potential food safe ris
Wenliang Xiang, Kekun Lu, Nandi Zhang, Qianwen Lu, Qin Xu
四川省食品生物技術(shù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
Food Research International ( IF 3.52 ) Pub Date : 2019-06, DOI: 10.1016/j.foodres.2018.11.032
文章鏈接：https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0963996918309177#!
MSDS
COA
提取過(guò)程中無(wú)法獲得基因組DNA
Answer
通常有多種因素會(huì)影響基因組DNA產(chǎn)量，包括樣本來(lái)源、樣本保存條件、樣本的預(yù)處理、操作等。
1. 土壤樣本保存不當(dāng)或保存時(shí)間太長(zhǎng)，導(dǎo)致土壤里面的菌落死亡，基因組DNA已經(jīng)降解。
建議：土壤樣本保存于-20℃或者-80℃；盡量采用新近采取的土壤樣本進(jìn)行基因組DNA的提取。
2. 土壤用量過(guò)少或者是特別貧瘠的荒地土?；牡赝帘旧砭浜亢苌?，如果樣本用量很少，可能導(dǎo)致提取不到相應(yīng)的基因組DNA。
建議：對(duì)于菌落含量較少的土壤樣本，盡量使用500mg樣本進(jìn)行基因組DNA提取操作。
3. 試劑盒保存不當(dāng)或存放時(shí)間太長(zhǎng)，導(dǎo)致試劑盒里面某些組分失效。
建議：購(gòu)置新的土壤基因組DNA提取試劑盒進(jìn)行相關(guān)操作。
4. 洗脫液沒(méi)有正確滴加到硅膠膜上。
建議：將65℃預(yù)熱的洗脫液滴加到硅膠膜的正中間，并在室溫放置5分鐘增加洗脫效率。
提取獲得低產(chǎn)量基因組DNA
Answer
1. 土壤樣本保存不當(dāng)或保存時(shí)間太長(zhǎng)，導(dǎo)致土壤里面大量的菌落死亡，基因組DNA降解。
建議：土壤樣本保存于-20℃或者-80℃；盡量采用新近采取的土壤樣本進(jìn)行基因組DNA的提取。
2. 土壤用量過(guò)少或者是特別貧瘠的荒地土?；牡赝帘旧砭浜亢苌伲鄳?yīng)的量提取到的基因組DNA含量會(huì)較少。
建議：對(duì)于菌落含量較少的土壤樣本，盡量使用500mg樣本進(jìn)行基因組DNA提取操作。
3. 洗脫液?jiǎn)栴}
建議：請(qǐng)使用Buffer EB進(jìn)行洗脫；如果使用ddH2O或其他洗脫液，確認(rèn)洗脫液的pH值在7-8.5之間。
4. 洗脫液沒(méi)有正確滴加
建議：請(qǐng)將洗脫液滴加到硅膠膜的正中間，并在室溫放置5分鐘增加洗脫效率。
5. 洗脫液體積太少
建議：請(qǐng)按說(shuō)明書(shū)上要求使用洗脫液進(jìn)行基因組DNA洗脫，最少不要低于100μL。
提取獲得基因組DNA純度低
Answer
基因組DNA純度低會(huì)導(dǎo)致下游實(shí)驗(yàn)的失敗或效果不理想，如：酶切不開(kāi)，PCR得不到目的基因片段等。
1. 樣品裂解不充分
分析：加入Buffer SG1后，沒(méi)有充分混勻，使得裂解液和樣品不能較好的反應(yīng)。
建議：務(wù)必按照說(shuō)明書(shū)要求上下顛倒劇烈混勻5sec，使得裂解液可以和樣品充分接觸，完成裂解。
2. 雜蛋白污染、RNA污染
分析：沒(méi)有使用Buffer PW洗滌純化柱；Buffer PW洗滌純化柱沒(méi)有使用正確的離心轉(zhuǎn)速。
建議：在上清液過(guò)柱時(shí)盡量保證上清液中無(wú)沉淀；務(wù)必按說(shuō)明書(shū)進(jìn)行Buffer PW洗滌純化柱，并且此步驟不能省略。
3. 雜質(zhì)離子污染
分析：省略了Buffer WB洗滌純化柱或者只洗滌了一次，導(dǎo)致殘留的離子污染。
建議：務(wù)必按說(shuō)明書(shū)使用Buffer WB洗滌2次，以盡量去除殘留的離子。
4. RNA酶污染
分析：Buffer中添加了外源的RNA酶；BufferPW洗滌操作不正確，導(dǎo)致RNA酶殘留，影響下游RNA實(shí)驗(yàn)操作，如：體外轉(zhuǎn)錄等。
建議：Foregene系列核酸提取試劑盒無(wú)需額外添加RNA酶即可去除RNA，Soil DNA Isolation Kit里面所有試劑均無(wú)需添加RNA酶；務(wù)必按說(shuō)明書(shū)進(jìn)行Buffer PW洗滌純化柱，并且此步驟不能省略。
5. 乙醇?xì)埩?/span>
分析：Buffer WB洗滌純化柱后，沒(méi)有進(jìn)行空管離心操作。
建議：按說(shuō)明書(shū)進(jìn)行正確的空管離心操作。
