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糞便基因組DNA提取試劑盒

無(wú)RNA酶污染:試劑盒提供的DNA-Only Column使得實(shí)驗(yàn)過(guò)程中無(wú)需額外添加RNA酶即可去除基因組DNA中的RNA,避免實(shí)驗(yàn)室遭受外源RNA酶污染。

速度快:操作簡(jiǎn)單,糞便基因組DNA提取操作在40分鐘內(nèi)即可完成。

方 便:離心操作均在常溫,無(wú)需4℃低溫離心或乙醇沉淀DNA。

安 全:無(wú)需有機(jī)試劑抽提。

質(zhì)量高:提取獲得的基因組DNA片段大、無(wú)RNA、無(wú)RNA酶、離子含量極低,能滿(mǎn)足各種實(shí)驗(yàn)的要求。

產(chǎn) 品 名 稱(chēng)

糞便基因組DNA提取試劑盒

Stool DNA Isolation Kit

貨    號(hào)DE-05713
規(guī)    格50T
價(jià)    格¥762.00
描    述

快速?gòu)母鞣N糞便樣本中純化獲得高質(zhì)量的基因組DNA。

產(chǎn)品介紹

本試劑盒提供了從各種來(lái)源的糞便樣本中快速簡(jiǎn)便的提取細(xì)菌、食物殘?jiān)然蚪MDNA的方法。糞便樣品中存在大量的抑制因子,這些物質(zhì)即使微量存在于純化后的DNA中也會(huì)對(duì)下游反應(yīng),如對(duì)PCR、限制性酶切等產(chǎn)生影響。因而純化糞便DNA的關(guān)鍵在于如何有效的去除糞便中的抑制因子。

本試劑盒采用可以特異性結(jié)合DNADNA-Only Column全新的Foregene Protease以及獨(dú)特的緩沖液體系,可以有效的去除糞便中各種抑制因子,無(wú)需有機(jī)溶劑抽提或乙醇及異丙醇沉淀,在40分鐘內(nèi)即可完成對(duì)糞便樣品中DNA的提取操作。


試劑盒應(yīng)用

該試劑適用于純化以下樣本基因組DNA:新鮮或凍存的人、牛、雞、小鼠等糞便樣本。


純化DNA的應(yīng)用

糞便基因組DNA提取試劑盒純化獲得的基因組DNA純度高,可用于常規(guī)分子生物學(xué)操作,如:酶切、PCR、Southern雜交、文庫(kù)構(gòu)建等實(shí)驗(yàn)。


DNA提取得率和純度

提取獲得的糞便基因組DNA量與糞便樣本的來(lái)源、存放時(shí)間、水分含量等因素相關(guān)。使用Stool DNA Isolation Kit處理各種來(lái)源糞便樣本,獲得的基因組DNA量和純度見(jiàn)下表

糞便來(lái)源

樣本用量(mg)

DNA產(chǎn)量(μg)

OD260/280

OD260/230

黃牛

200

4-6

1.7-1.9

1.7-1.9

家豬

200

4-6

1.7-1.9

1.8-1.9

家禽()

200

4-6

1.7-1.9

1.7-1.8

注意:此表數(shù)據(jù)僅作參考,實(shí)際操作中由于所用材料的存儲(chǔ)條件、操作熟練度等因素影響,所得數(shù)據(jù)會(huì)與此表數(shù)據(jù)有些許出入。


試劑盒內(nèi)容

Lysozyme:酶解陽(yáng)性菌細(xì)胞壁。

Buffer TE:用于配制100mg/ml Lysozyme的溶液和提供溶菌酶酶解環(huán)境。

Buffer SL1:提供樣本蛋白酶酶解環(huán)境。

Foregene Protease:在蛋白酶酶解環(huán)境下酶解樣本,釋放基因組DNA

Buffer SL2:去油脂類(lèi)雜質(zhì)。

Buffer SL3:失活蛋白酶并提供DNA上柱環(huán)境。

Buffer PW:去除DNA中的蛋白質(zhì)、RNA等雜質(zhì)。

Buffer WB:去除DNA中的殘留的鹽離子。

Buffer EB:洗脫純化柱膜上的DNA。

DNA-only Column:特異吸附裂解產(chǎn)物中的基因組DNA


產(chǎn)品信息

型號(hào)

離心柱型

純化組件

Foregene離心柱、試劑

通量

1-24個(gè)樣品

制備時(shí)間

~40 min (24個(gè)樣品)

離心機(jī)

臺(tái)式離心機(jī)

組織酶解物分離

離心分離

離心柱液體盛裝量

800 μL

純化柱DNA承載量

80 μg

洗脫體積

50-200 μL

糞便樣本處理量

50-200 mg


操作流程

糞便基因組DNA提取-1


  • 提取過(guò)程中無(wú)法獲得基因組DNA

    Answer

    通常有多種因素會(huì)影響基因組DNA產(chǎn)量,包括樣本來(lái)源、樣本保存條件、樣本的預(yù)處理、操作等。

    1.    糞便樣本保存不當(dāng)或保存時(shí)間太長(zhǎng),導(dǎo)致糞便里面的菌落死亡,基因組DNA已經(jīng)降解。

    建議:糞便樣本保存于-20或者-80,并盡量避免反復(fù)凍融;盡量采用新近采取的糞便樣本進(jìn)行基因組DNA的提取。

    2.    糞便用量過(guò)少。如果樣本用量很少,可能導(dǎo)致提取不到相應(yīng)的基因組DNA

    建議:對(duì)于菌落含量較少的糞便樣本,盡量使用200mg樣本進(jìn)行基因組DNA提取操作。

    3.    試劑盒保存不當(dāng)或存放時(shí)間太長(zhǎng),導(dǎo)致試劑盒里面某些組分失效。

    建議:購(gòu)置新的糞便基因組DNA提取試劑盒進(jìn)行相關(guān)操作。

    4.    Buffer WB沒(méi)有添加無(wú)水乙醇。

    建議:確認(rèn)Buffer WB中添加正確體積的無(wú)水乙醇。

    5.    洗脫液沒(méi)有正確滴加到硅膠膜上。

    建議:將65預(yù)熱的洗脫液滴加到硅膠膜的正中間,并在室溫放置5分鐘增加洗脫效率。

    6.    沒(méi)有使用專(zhuān)用的試劑盒進(jìn)行糞便基因組DNA的提取。

    建議:使用糞便專(zhuān)用的Stool DNA Isolation Kit進(jìn)行糞便基因組DNA的提取。


  • 提取獲得低產(chǎn)量基因組DNA

    Answer

    1.    糞便樣本保存不當(dāng)或保存時(shí)間太長(zhǎng),導(dǎo)致糞便里面大量的菌落死亡,基因組DNA降解。

    建議:糞便樣本保存于-20或者-80,并避免反復(fù)凍融;盡量采用新近采取的糞便樣本進(jìn)行基因組DNA的提取。

    2.    糞便用量過(guò)少,提取到的基因組DNA含量會(huì)較少。

    建議:盡量使用50-200mg樣本進(jìn)行基因組DNA提取操作,如樣本量確實(shí)較少,可適當(dāng)?shù)倪M(jìn)行增菌培養(yǎng)后再進(jìn)行提取。

    3.    洗脫液?jiǎn)栴}。

    建議:請(qǐng)使用Buffer EB進(jìn)行洗脫;如果使用ddH2O或其他洗脫液,確認(rèn)洗脫液的pH值在7.0-8.5之間。

    4.    Foregene Protease保存不當(dāng),導(dǎo)致其活性降低或失活。

    建議:確認(rèn)Foregene Protease保存條件或者更換新的Foregene Protease進(jìn)行酶解反應(yīng)。

    5.    洗脫液沒(méi)有正確滴加。

    建議:將65預(yù)熱的洗脫液滴加到硅膠膜的正中間,并在室溫放置5分鐘增加洗脫效率。

    6.    洗脫液體積太少。

    建議:請(qǐng)按說(shuō)明書(shū)上要求使用洗脫液進(jìn)行基因組DNA洗脫,最少不要低于60μL

  • 提取獲得基因組DNA純度低

    Answer

    基因組DNA純度低會(huì)導(dǎo)致下游實(shí)驗(yàn)的失敗或效果不理想,如:酶切不開(kāi),PCR得不到目的基因片段等。

    1.    樣品裂解不充分。

    分析:加入Buffer SL1后,沒(méi)有充分混勻,使得裂解液和樣品不能較好的反應(yīng)。

    建議:務(wù)必按照說(shuō)明書(shū)要求上下顛倒劇烈混勻5sec,使得裂解液可以和樣品充分接觸,完成裂解。

    2.    雜質(zhì)吸附不完全。

    分析:在加入Buffer SL2前沒(méi)有將Buffer SL2充分混勻后,或是在加入后沒(méi)有充分混勻或加入Buffer SL2量較少,使得吸附劑不能完全吸附樣品中的雜質(zhì)。

    建議:務(wù)必按照說(shuō)明書(shū)要求在使用前Buffer SL2充分混勻,保證溶液沒(méi)有分層和結(jié)塊,并加入正確體積的Buffer SL2并上下顛倒充分混勻,使得吸附劑可以和樣品充分接觸,起到徹底吸附雜質(zhì)的作用。

    3.    雜蛋白污染、RNA污染。

    分析:沒(méi)有使用Buffer PW洗滌純化柱;Buffer PW洗滌純化柱沒(méi)有使用正確的離心轉(zhuǎn)速。

    建議:在上清液過(guò)柱時(shí)盡量保證上清液中無(wú)沉淀;務(wù)必按說(shuō)明書(shū)進(jìn)行Buffer PW洗滌純化柱,并且此步驟不能省略。

    4.    雜質(zhì)離子污染。

    分析:省略了Buffer WB洗滌純化柱或者只洗滌了一次,導(dǎo)致殘留的離子污染。

    建議:務(wù)必按說(shuō)明書(shū)使用Buffer WB洗滌2次,以盡量去除殘留的離子。

    5.    RNA酶污染。

    分析:Buffer中添加了外源的RNA酶;Buffer PW洗滌操作不正確,導(dǎo)致RNA酶殘留,影響下游RNA實(shí)驗(yàn)操作,如:體外轉(zhuǎn)錄等。

    建議:Foregene系列核酸提取試劑盒無(wú)需額外添加RNA酶即可去除RNA, Soil DNA Isolation Kit里面所有試劑均無(wú)需添加RNA酶;務(wù)必按說(shuō)明書(shū)進(jìn)行Buffer PW洗滌純化柱,并且此步驟不能省略。

    6.    乙醇?xì)埩簟?/span>

    分析:Buffer WB洗滌純化柱后,沒(méi)有進(jìn)行空管離心操作。

    建議:按說(shuō)明書(shū)進(jìn)行正確的空管離心操作。


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COA